Шигели - рід кишкових бактерій, що включає різні види збудників дизентерії. Вітчизняна класифікація (1962) ділить цей рід за біохімічними ознаками на три групи: 1) несбраживающие маніт (види Григор'єва - Шиги, Штуцера - Шмітца, Ларджа - Сакса, провізорні), 2) сбраживающие маніт - вид Флекснера, що включає 3 підвиди (власне Флекснера, Ньюкасла, Бойда), і 3) повільно розкладають лактозу (вид Зонне). Подальша диференціація шигел на типи і підтипи здійснюється за серологічним ознаками, які базуються на особливостях антигенної структури.
Збудники дизентерії - грамнегативні нерухомі палички довжиною 2-3 мк, шириною 0,6 мк, легко розмножуються на звичайних поживних середовищах при t° 37°. За типом дихання - аероби і факультативні анаероби, на поверхні агару утворюють напівпрозорі ніжні колонії.
Шигели - це рід патогенних тільки для людини і мавп мікроорганізмів; належить до сімейства кишкових бактерій (Enterobacteriaceae).
Перший представник роду описаний Шигой (К. Shiga); його ім'ям і позначений рід.
Існують дві класифікаційні схеми шигел: прийнята в СРСР (1962) і Міжнародна (1950-1958).ці схеми схожі, так як вони включають єдиний перелік шигел; базуються на єдиному принципі підрозділу дизентерійних бактерій по їх відношенню до манниту і антигенною будовою. Всі шигели, за винятком підвиду Флекснера, в антигенному відношенні відокремлені один від одного і володіють кожен «своїм» видо - або типоспецифическим антигеном. Шигели види Флекснера містять поряд з типоспецифическим антигеном, визначальним серологічний тип, ряд групових антигенів (див. Дизентерія, етіологія). Склад останніх дозволяє розмежовувати палички Флекснера, що володіють єдиним типоспецифическим антигеном (єдиного серотипу), на серологічні підтипи (табл. 1).
| Серологічний тип | Підтип | Антигени | |
| типоспецифічний | групові | ||
| 1 | 1a | I | 3,4 | 
| 1b | 3,4 6 | ||
| 2 | 2a | II | 3,4 | 
| 2b | 7,8 | ||
| 3 | 3a | III | 6 7,8 | 
| 3b | 3,4 6 (7,8) | ||
| 3c | 6 | ||
| 4 | 4a | IV | 3,4 | 
| 4b | (3,4) 6 | ||
| 5 | V | 7,8 | |
| x | - | 7,8 | |
| y | - | 3,4 | |
 Визначення підтипу здійснюється за допомогою спеціального набору групових агглютинирующих сироваток в дослідах аглютинації на склі. Шигели підвиду Флекснера, на відміну від інших представників роду, мають і так званими фимбриальными, або реснитчатыми, антигенами, загальними для всіх серологічних типів.
 Вірулентність шигел (патогенність для людини) визначають в даний час на ряді лабораторних моделей - проба Шереня на оці морської свинки, «легенева» модель М. К. Войно-Ясенецкой, вирощування на культурах тканин (Ст. А. Арбузова). Шигели диференціюють з морфології, біохімічним властивостям і агглютинаторной характеристиці. В табл. 2 дано перелік зустрічаються у шигел ферментативних варіантів.
| Ознаки | Закономірність | Відхилення | |
| Рухливість | Нерухомі | Невідомі | |
| Газоутворення | Не утворюють газу | Тільки Ньюкасл | |
| Ферментація | Маніт | Не ферментують: Григор'єва - Шига, Штуцера - Шмітц, Лардж - Сакс | Тільки Лардж - Сакс (одиничні спостереження) | 
| Ферментують: Флекснер, Ньюкасл, Бойд, Зонне | Ньюкасл (оригінальний штам, зустрічається виключно рідко). Флекснер, Зонне, Бойд (дуже рідко) | ||
| Лактоза | Ферментують: тільки Зонне | Зонне (виключно рідко), Бойд 9, окремі різновиди цього серотипу повільно розщеплюють лактозу | |
| Ксилоза | Не ферментують: Флекснер, Ньюкасл | Серотип 4 (Бойд 103), окремі рідкісні різновиди | |
| Дульцит | Не ферментують: Флекснер, Зонне | Невідомі | |
| Сорбіт | Не ферментують: Зонне | Невідомі | |
 При серологічної ідентифікації, особливо при використанні методу аглютинації на склі з монорецепторными сироватками, необхідно враховувати наявність серологічних зв'язків між шигел і представниками деяких серологічних груп Escherichia. Соматичні антигени ряду шигел і Escherichia ідентичні.
 Шигели, як і ряд інших представників сімейства кишкових бактерій, що володіють здатністю продукувати коліціни і за характером продукованого колицина можуть бути підрозділені на ряд різних колициногенотипов. См. також Бактерії.
