Энцефалитические ускладнення, як правило, виникають у первинно щеплених. В останні роки зустрічаються лише поодинокі випадки захворювання, переважно в дитячому віці, але відомі захворювання і дорослих. Мабуть, віковий склад хворих залежить від того, в якому віці проводиться первинна вакцинація. Інкубаційний період в середньому 10-12 днів (можливі коливання від 3 до 35). Захворювання розвивається раптово. В перший день хвороби температура досягає 39-40°. Хворий відчуває сильний головний біль, часто буває блювота. Швидко розвивається сопорозний стан або більш глибоке порушення свідомості аж до коми. Часто спостерігаються загальні судомні напади, особливо у дітей молодшого віку.
Після судом можуть виявлятися симптоми вогнищевого ураження головного або спинного мозку, моно - і геміпарези, нижні парапарези. Глибокі рефлекси і тонус звичайно знижуються, поряд з цим часто виявляються патологічні рефлекси, порушується функція сфінктерів. Нерідко спостерігаються міоклонічні або хореатические посмикування, тремор, інколи тонічні судоми. У випадках важкого перебігу хвороби з'являються бульбарні симптоми. Черепно-мозкові нерви уражаються рідко, у деяких випадках бувають птоз, нерівномірність зіниць, зниження реакції їх на світло, косоокість, асиметрія обличчя, тризм, неврит зорових нервів. Спинномозкова рідина не змінена, лише в рідкісних випадках буває помірний плеоцитоз, тиск її в більшості випадків підвищено. Виразних змін чутливості не виявляється.
У випадках легкого і абортивного перебігу через 10-12 днів після вакцинації підвищується температура і виникають легкі і швидко проходять симптоми подразнення мозкових оболонок. Відмінності в клінічній картині поствакцинных енцефалітів у різних країнах стосуються головним чином частоти менингеального синдрому, судомних припадків і тяжкості перебігу. Тривалість захворювання від декількох днів до 2 тижнів. Смертельний результат наступає в перші дні хвороби при явищах судом, коми, асфіксії (летальність від 14 до 50%). При сприятливому результаті хвороби энцефалитические симптоми швидко зникають і більшість хворих одужує без резидуальних органічних дефектів.
